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Ver el documento (formato PDF)   Giancola, Sandra M..  "Caracterización y diferenciación de Germoplasma de Soja (Glycine max (L.) Merr.) mediante marcadores moleculares"  (1998)
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
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Resumen:
La soja es una especie autopolinizante de escasa variabilidad genética. Esta variabilidad se ve aún más reducida en variedades cultivadas de soja (Glycine max (L.) Merr.) debido a que en los programas de mejoramiento, usualmente se utilizan los mismos ancestros. Debido a esta escasa variabilidad genética es que resulta difícil la identificación y diferenciación de nuevos cultivares. El objetivo de este trabajo fue testear la capacidad que tienen los diferentes marcadores moleculares tales como, RAPD (amplificación azarosa de ADN polimórfico), AFLP (Polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados) y Microsatélites o SSR (secuencias repetitivas simples), para caracterizar y diferenciar un conjunto de 100 variedades de soja registradas en el Registro Nacional de Cultivares del Instituto Nacional de Semillas (INASE), perteneciente a la Secretaría de Agricultura, Ganadería, Pesca y Alimentación. Fueron utilizadas 16 características morfológicas, fisiológicas y fenológicas para comparar la relación genética obtenida con los marcadores moleculares. Se analizaron 424 loci genómicos polimórficos entre marcadores moleculares y morfológicos mostrando un porcentaje global de polimorfismo del 25.7% confirmando la baja variabilidad genética relativa de la soja comparada con otros cultivos y explicada por la estrecha base genética con que se maneja el mejoramiento de esta planta La variabilidad evidenciada por cada uno de los sistemas de marcadores fue diferente. Las variedades fueron agrupadas por el sistema de “cluster analysis” y los resultados comparados con los datos genealógicos de las variedades registradas, concluyéndose que los microsatélites son los marcadores que mejor reflejan la evolución genómica de las variedades y mejor se correlacionan con la diferenciación morfológica. Los AFLP mostraron un alto rango de multiplex, pero bajo polimorfismo, en cambio los RAPD mostraron un valor intermedio de polimorfismo y bajo rango de multiplex. Se logró establecer una “huella digital genética” para cada variedad y realizar un estudio de variabilidad genética, estimando la distancia mínima a considerar para la obtención de la propiedad.

Abstract:
Soybean is a self pollinating species of limited genetic variability. This variability is further reduced in soybean cultivars (Glycine max (L) Merr.) due to the fact that they are usually derived from crosses among members of an elite group of genetically related parents. This limited variability is sometimes insufficient to unambiguously identify new cultivars. The aim of this work is to test the feasibility of using different molecular markers such as “Random Amplified Polymorphic DNA” (RAPD), “Amplified Fragments Length Polymorphism” (AFLP) and Microsatellite or Simple-Sequence-Repeat (SSR) to characterize and differentiate a set of 100 soybean varieties registered at the National Register of Cultivars of the National Seed Institute of Argentina (INASE, Secretariat of Agriculture, Livestock, Fisheries and Food). Sixteen known basic morphological, physiological and phenological traits were also recorded for each variety in order to compare the relationships among varieties derived from molecular markers. The calculated variability indexes showed to be highly dependent on the specific technique used for the analysis ranging from 0.262 for SSR analysis, 0.401 for RAPD and AFLP analysis and 0.574 for morphological traits analysis. In total 109 polymorphic genomic loci were scored revealing a lower genetic variability when compared with published data of other species. The varieties were grouped by cluster analysis and the relationships derived from these cluster analysis was compared with known pedigree data of the registered varieties. The SSR data showed the best fit to pedigree data while mantaining an acceptable correlation to morphologically-based separation. AFLP showed a high multiplexity but low percentage of polymorphic bands while RAPD was low in multiplexity but with a better level of polymorphism. A genetic fingerprint was established for each one of the 100 varieties and a minimum genetic distance for distinctness definition within UPOV concept could be defined.

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Registro:
Título : Caracterización y diferenciación de Germoplasma de Soja (Glycine max (L.) Merr.) mediante marcadores moleculares    
Autor : Giancola, Sandra M.
Director : Hopp, Horacio Esteban
Año : 1998
Editor : Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Filiación : Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) Castelar. Instituto de Investigaciones en Ciencias Veterinarias (CICV). Instituto de Biotecnología
Instituto Nacional de Semillas (INASE)
Grado obtenido : Doctor en Ciencias Biológicas
Ubicación : Preservación - http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_3059_Giancola
Idioma : Español
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