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Ver el documento (formato PDF)   Marquina, Silvia Andrea.  "Estudio sobre la variabilidad genética del virus de la inmunodeficiencia humana"  (1999)
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
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Resumen:
El estudio de la variabilidad viral es importante para entender la patogenia, la evolución y la epidemiología del HIV. Esta tesis aborda la variabilidad del HIV desde diversos ángulos. Uno de ellos fue la caracterización molecular del HIV-1 en ciudades con corrientes migratorias importantes como Buenos Aires. San Petersburgo y Estocolmo. Se demostró que estas corrientes introdujeron subtipos del HIV-1 que no circulaban previamente y la existencia de un nuevo subtipo del HIV-1, conocido actualmente como subtipo J. Se caracterizaron cadenas epidemiológicas de transmisión de la infección determinando que las recombinantes virales son frecuentes y transmisibles por vía horizontal y vertical, lo que constituye un hecho de importancia epidemiológica. La presencia de recombinantes virales motivó el desarrollo de un método para buscar posibles sitios de recombinación genómica y otro filogenético que toma en cuenta el evento de recombinación, importante en la evolución de HIV.Además se demostró que la hipermutación G—>A está restringida por la estabilidad del ARN viral. Además del HIV-1 se estudió el HIV-2 y se confirmó el predominio del subtipo A en Guinea Bissau. La carga proviral y el recuento de linfocitos T CD4+ resultaron marcadores del estadio de la infección con HIV-2 similar a lo que ocurre con HIV-1. Existe relación entre el genotipo y el fenotipo viral ya que aislamientos "rapid/high" presentaron aminoácidos positivos con patrones similares al HIV-1. Por otra parte se estudió la contribución del ADN viral extracromosómica a la variabilidad genética in vitro e in vivo resultando que una linea celular persistentemente infectada con HIV-1 puede ser sobre infectada por otra variante cuyo ADN se localiza en la fracción extracromosómica y se dispersa sólo por contacto célula a célula. In vivo el ADN viral extracromosómico contribuye a la variabilidad genética en la población viral de individuos infectados con el HIV-1. En conclusión, aquí se discuten algunos aspectos acerca de la variabilidad genética del HIV desde los puntos de vista molecular, evolutivo y epidemiológico. Además la tesis sugiere posteriores estudios particularmente en los temas de recombinación y sobreinfección para enriquecer el conocimiento sobre la variabilidad del HIV.

Abstract:
Research on viral variability is a crucial issue to understand the pathogenesis, evolution and epidemiology of HIV. This work focuses on the variability issue from different angies. One of this is the HIV-1 molecular characterization in cities with great migratory influx such as Buenos Aires, St. Petersburg and Stockholm. These migrations resulted in the introduction of HIV-1 subtypes that were not previously circulating. The existence of a new HIV-1 subtype, currently known as subtype J was demonstrated. Epidemiological transmission chains were characterized demonstrating that viral recombinants are frequently found and that they are transmissible horizontally and vertically, fact that is epidemiological important. The evidence of viral recombinants lead to the development of a method for searching possible recombination sites and of a phylogenetic method which takes into account the recombination event, relevant during HIV evolution. Besides, G—>A hypermutation is restricted by RNA stability. Besides HIV-1, HIV-2 was studied and the predominance of subtype A was confirmed in Guinea Bissau. Proviral load and T CD4+ cell count demonstrated to be markers of stage of HIV-2 infection similar to HIV-1. There is a correlation between the genotype and the phenotype because "rapid/high" isolates presented positively charged amino acids in env region, similarly to HIV-1. On the other hand, extrachromosomic contribution to variability in vitro and in vivo was studied. A persistently infected cell line can be super infected with other variant whose DNAis in the extra chromosomic fraction and it spreads only by cell to cell contact. Extrachromosomic viral DNA contributes to in vivo genetic variability in HIV-1 infected individuals. Finally, several aspects of HIV genetic variability are discussed from different points of view such as molecular, evolutionary and epidemiological aspects. Besides, this work suggests further studies particularly in recombination and superinfection issues in order to enrich the knowledge about HIV variability.

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Registro:
Título : Estudio sobre la variabilidad genética del virus de la inmunodeficiencia humana    
Autor : Marquina, Silvia Andrea
Director : Martínez Peralta, Liliana
Año : 1999
Editor : Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Filiación : Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología
Grado obtenido : Doctor en Ciencias Químicas
Ubicación : Preservación - http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_3120_Marquina
Idioma : Español
Area Temática : Biología / Virología
Palabras claves : HIV; VARIABILIDAD; SUBTIPOS; FILOGENIA; CADENAS DE TRANSMISION; SOBREINFECCION; ADN NO INTEGRADO; HIPERMUTACION; ESTRUCTURA SECUNDARIA; HIV; VARIABILITY; SUBTYPES; PHYLOGENY; TRANSMISSION CHAINS; SUPERINFECTION; UNINTEGRATED DNA; HYPERMUTATION; SECONDARY STRUCTURE
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