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Ver el documento (formato PDF)   Lorenzi, Hernán Alejandro.  "Estructura genómica y diseño de nuevos vectores de transfección para Trypanosoma cruzi"  (2001)
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
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Resumen:
Trypanosoma cruzi es un parásito protozoario causante de la enfermedad de Chagas. Dentro del marco del proyecto genoma de T. cruzi y como un activo aporte a su concreción, se ha caracterizado un nuevo tipo de marcador genético asociado a la secuencia repetida SIRE denominado SAS, que condujo a la identificación de cuatro nuevos genes y de las secuencias repetidas TCREL y VIPER. Para contribuir a la construcción del mapa fisico, se construyó y caracterizó una biblioteca de ADN genómico de T. cruzi en vectores YAC con un tamaño promedio de inserto de 365 kpb, que fue utilizada para construir el mapa fisico de una región de ~900 kpb del cromosoma XVI y comenzar la construcción del mapa fisico del cromosoma XX. También se construyeron cromosomas circulares en levaduras por el método de clonado RAT utilizando las secuencias repetidas como base del clonado, y se probó la utilidad de un vector de fragmentación que sirvió para ubicar el gen TcP2β cerca de una región telomérica de un cromosoma de ~1 Mpb. Para contribuir con los estudios genómicos funcionales se diseñó y construyó el vector necesario para obtener cromosomas artificiales de T. cruzi. Finalmente, estos estudios llevaron a utilizar comparaciones de secuencia para definir las características de sintenía de extensas regiones genómicas de T. cruzi, Trypanosoma brucei y Leishmania major.

Abstract:
Trypanosoma cruzi is a parasitic protozoan that causes Chagas disease. As part of the T. cruzi genome project and to contribute to its concretion we have characterized a new type of chromosomal marker associated to the repetitive element SIRE named SAS, that allowed the identification of four novel genes and two repetitive sequences, TcREL and VIPER. To accomplish the construction of the physical map of the T. cruzi genome, we constructed and characterized a genomic YAC library of T. cruzi with an average insert-size of 365 kbp that was used to get the physical map of a ~900 kbp region from chromosome XVI and to start the assembly of contigs from chromosome XX. In addition, we also constructed circular artificial chromosomes in yeast, based on a T. cruzi repetitive sequence by RAT cloning, and verified the utility of a fragmentation vector in the position of the TcP2β gene near a telomeric region of a chromosome of ~1 Mbp. To perform functional genomic studies we designed and constructed a vector that can be used as an artificial chromosome in T. cruzi. Finally, comparison and sequence analysis allowed us the identification of large genomic sintenic regions among T. cruzi, Trypanosoma brucei and Leishmania major.

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Registro:
Título : Estructura genómica y diseño de nuevos vectores de transfección para Trypanosoma cruzi     =    Genomic structure and development of novel transfection vectors for Trypanosoma cruzi
Autor : Lorenzi, Hernán Alejandro
Director : Levin, Mariano Jorge
Año : 2001
Editor : Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Filiación : Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular, "Dr. Héctor N. Torres" (INGEBI)
Grado obtenido : Doctor en Ciencias Biológicas
Ubicación : Preservación - http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_3420_Lorenzi
Idioma : Español
Area Temática : Biología / Parasitología
Biología / Genética
Biología / Biología Molecular y Celular
Palabras claves : TRYPANOSOMA CRUZI; MARCADORES GENOMICOS; ORGANIZACION GENOMICA; CROMOSOMA ARTIFICIAL; FRAGMENTACION CROMOSOMICA; TRYPANOSOMA CRUZI; GENOMIC MARKERS; GENOMIC ORGANIZATION; ARTIFICIAL CHROMOSOME; CHROMOSOME FRAGMENTATION
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