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Ver el documento (formato PDF)   Carbonetto, María Belén.  "Diversidad de las comunidades microbianas de los suelos pampeanos. Enfoques ecológicos y metagenómicos"  (2014)
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
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Resumen:
El suelo es uno de los ambientes más biodiversos y heterogéneos del planeta y los ciclos biogeoquímicos que en él suceden son de suma importancia para la vida. Estos procesos son llevados a cabo por microorganismos, mayoritariamente del grupo Bacteria y Arquea. A su vez, el suelo es un recurso esencial para los seres humanos ya que es su fuente principal de alimentos, pero como cualquier recurso natural, es finito. Por lo tanto el estudio del impacto de las modificaciones agrícolas en las características físicas, químicas y biológicas del suelo y por ende en los procesos del ecosistema, es imprescindible. El 50% de la superficie de Región Pampeana está dedicada a la agricultura. El impacto de las prácticas agrícolas sobre las características físicas y químicas del suelo, ha sido ampliamente estudiado en la región. Sin embargo, y más allá del gran esfuerzo realizado, todavía hay una deuda por comprender las consecuencias del uso agrícola sobre la biodiversidad y procesos biológicos. El trabajo aquí presentado pretende saldar parte de esta deuda estudiando el impacto que ejerce la agricultura sobre las comunidades bacterianas de suelos de la Región Pampeana. Se utilizaron técnicas de metagenómica y un enfoque ecológico. El primer capítulo se centró en estudiar el impacto de más de 100 años de agricultura sobre la estructura de las comunidades microbianas y sus perfiles metabólicos (metagenómicos). Se encontraron diferencias significativas entre comunidades de suelos con y sin historia de manejo agrícola. El segundo capítulo se dedicó a la comparación de dos sistemas de labranza. Se estudió la estructura de diversidad y el perfil metagenómico de comunidades de suelos bajo labranza convencional y bajo siembra directa. Vimos que las comunidades difirieron en su composición taxonómica y metabólica según el tipo de labranza a la cual fueran sometidas. El objetivo del tercer capítulo fue determinar el patrón regional de distribución bacteriano. Este análisis se realizó dentro del marco de la Teoría de Metacomunidades y utilizando datos de suelos con y sin historia de manejo de una transecta Este-Oeste que abarcó el gradiente edáfico y climático completo de la Región Pampena. Los resultados mostraron que los efectos de la dispersión fueron más importantes que los efectos contemporáneos a nivel regional, enmascarando así los impactos locales generados por el uso agrícola.

Abstract:
Soil is one of the most biodiverse and heterogeneous environments of Earth. Soil bio-chemical processes are essential for life and are carried out by microorganisms, mainly Bacteria and Archaea. Moreover soil is very important for humans, since it is the main source of food; but as any other natural resource it is not limitless. Though studying the impact of agriculture on soil physical, chemical and biological characteristics, and hence on ecosystem processes is imperative. The 50% of Pampas surface is devoted to agriculture. The impact of agricultural practices on soil physical and chemical properties has been extensively studied in the region. However, beyond the great effort made, there is a debt yet to understand the consequences of agriculture on biodiversity and biological processes. The work presented here aims to repay part of this debt by studying the impact of agriculture on soil bacterial communities of the Pampas. We used an ecological approach and 50% of the surface of Pampas is devoted to agriculture. The impact of agricultural practices on soil physical and chemical characteristics has been extensively studied in the region. However, beyond the great effort made, there is a debt yet to understand the consequences of agricultural biodiversity and biological processes. The work presented here aims to repay this debt of studying the impact that agriculture on soil bacterial communities of the Pampas. We used an ecological approach and metagenomics. The first chapter was focused on the study of the impact of over 100 years of farming on the structure of microbial communities and their metabolic (metagenomic) profiles. Significant differences between communities of soils with and without a history of agricultural management were found. The second chapter is devoted to the comparison of two tillage systems. We studied the structure and metagenomic profiles of soil communities under conventional tillage and no-tillage. We found that communities differ in their taxonomical composition and metabolisms. The aim of the third chapter was to determine the regional pattern of bacterial distribution. This analysis was performed within the framework of the theory of metacommunities. We sampled soils with and without soil management history, in an East-West transect that spanned the entire climatic and edaphic gradient of the Pampas. The results showed that dispersion was more important than environmental contemporaneous effects at the regional level, thus masking local impacts generated by agricultural use.

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Registro:
Título : Diversidad de las comunidades microbianas de los suelos pampeanos. Enfoques ecológicos y metagenómicos     =    Diversity of soil microbial communities of the Pampas. Ecological and metagenomic approaches
Autor : Carbonetto, María Belén
Director : Vázquez, Martín P.
Consejero : Kornblihtt, Alberto
Jurados : Correa, Olga S.  ; López, Nancy I.  ; Ruiz, Oscar A.
Año : 2014
Editor : Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Filiación : Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Predio del Centro Científico Tecnológico Rosario-Conicet (CCT-Rosario). Instituto de Agrobiotecnología Rosario (INDEAR). Plataforma de Genómica y Bioinformática
Grado obtenido : Doctor de la Universidad de Buenos Aires en el área de Ciencias Biológicas
Ubicación : Preservación - http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_5465_Carbonetto
Idioma : Español
Area Temática : Biología / Microbiología
Biología / Ecología
Biología / Genética
Palabras claves : ECOLOGIA MICROBIANA; MICROBIOLOGIA DE SUELOS; REGION PAMPEANA; METAGENOMICA; AGRICULTURA; MICROBIAL ECOLOGY; SOIL MICROBIOLOGY; ARGENTINE PAMPAS; METAGENOMICS; AGRICULTURE
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