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Ver el documento (formato PDF)   Perez-Santangelo, Ma. Soledad.  "El rol de los genes LSM en la regulación de los ritmos circadianos"  (2016-03-17)
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
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Resumen:
Los relojes circadianos son mecanismos auto-regulatorios endógenos que controlan la periodicidad de múltiples procesos biológicos. Éstos proporcionan a los organismos una ventaja adaptativa que permite sincronizar distintos eventos fisiológicos y del desarrollo al momento más adecuado del día. La regulación del reloj circadiano ocurre principalmente mediante circuitos de retroalimentación transcripcional. Sin embargo, estudios recientes muestran que se requiere de mecanismos post-transcripcionales para el correcto funcionamiento del reloj. Uno de estos mecanismos es el splicing alternativo, mediante el cual se producen múltiples variantes de ARNm a partir de un único gen. En esta tesis se caracterizó el comportamiento circadiano de mutantes de factores de splicing cuyos transcriptos están regulados por el reloj. Se encontró que mutaciones en los genes LSM5 y LSM4, que codifican para componentes del complejo spliceosomal U6 snRNP, alteran el período circadiano. Un análisis global del transcriptoma de ambas mutantes reveló enriquecimiento en genes implicados en la regulación de la transcripción y respuestas de estrés, así como alteraciones en el splicing alternativo de un subconjunto de genes, incluyendo genes centrales y de vías de salida del reloj. Los genes LSM también forman parte de otro complejo involucrado en el decaimiento del ARNm. Dado que LSM4 y LSM5 son parte de los dos complejos nos preguntamos si parte del efecto circadiano observado era debido a su rol sobre el decaimiento de ARNm. Se encontró que mutaciones en varios genes involucrados en decaimiento de ARNm también generan alteraciones en los ritmos circadianos. Estos resultados apoyan la idea de que ciertos genes LSM desempeñan un rol en los ritmos circadianos, mediante la regulación del splicing alternativo y del decaimiento de ARNm, lo cual contribuye a la sincronización de los ritmos biológicos con cambios ambientales.

Abstract:
Circadian clocks are endogenous self-regulatory mechanisms that control the periodicity of multiple biological processes. These provide organisms with an adaptive advantage that allows them to synchronize different physiological and developmental events to the most appropriate time of day. The regulation of the biological clock occurs mainly through transcriptional feedback loops. However, recent studies show that post-transcriptional mechanisms are required for proper functioning of the clock. One of these mechanisms is alternative splicing, a process through which multiple mRNA variants are produced from a single gene. In this thesis we characterized the circadian behavior of splicing factors mutants, affected in genes whose transcripts are regulated by the clock. We found that mutations in LSM5 and LSM4 genes, encoding U6 snRNP spliceosomal complex components, change the circadian period. Genome-wide transcriptome analysis of both mutants revealed enrichment in genes involved in transcriptional regulation and stress responses, as well as changes in alternative splicing of a subset of genes, including central and output clock genes. The LSM genes are also part of another complex involved in mRNA decay. Since LSM5 and LSM4 are part of both complexes, we wondered if part of the circadian effect observed in the mutants was due to their role on mRNA decay. We found that mutations in other genes involved in mRNA decay also generate changes in circadian rhythms. These findings support the idea that some LSM genes play a role in circadian rhythms through the regulation of alternative splicing and mRNA decay, which helps synchronize biological rhythms with environmental changes.

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Registro:
Título : El rol de los genes LSM en la regulación de los ritmos circadianos     =    Role for LSM genes in the regulation of circadian rhythms
Autor : Perez-Santangelo, Ma. Soledad
Director : Yanovsky, Marcelo J.
Consejero : Maldonado, Sara
Jurados : Boccaccio, Graciela Lidia  ; Palatnik, Javier Fernando  ; De Gaudenzi, Javier Gerardo
Año : 2016-03-17
Editor : Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Filiación : Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Fundación Instituto Leloir
Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBBA)
Grado obtenido : Doctor de la Universidad de Buenos Aires en el área de Ciencias Biológicas
Ubicación : Preservación - http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_5921_PerezSantangelo
Idioma : Español
Area Temática : Biología / Biología Molecular y Celular
Palabras claves : ARABIDOPSIS; RITMOS CIRCADIANOS; LSM5; LSM4; SPLICING ALTERNATIVO; U6SNRNP; DECAIMIENTO DE ARNM; ARABIDOPSIS; CIRCADIAN RHYTHMS; LSM; ALTERNATIVE SPLICING; U6SNRNP; DECAY OF MRNA
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