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Ver el documento (formato PDF)   Godoy Herz, Micaela.  "Regulación del splicing alternativo y de la elongación de la transcripción en plantas por acción de la luz"  (2017-03-23)
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
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Resumen:
La luz es un estímulo ambiental que regula varios procesos biológicos en las plantas. A través del cloroplasto, la luz regula el splicing alternativo de un conjunto de genes. En este trabajo nos propusimos estudiar los mecanismos por los que la luz realiza esta regulación. Tomamos como modelo el gen RS31, que codifica para un factor de splicing rico en serinas y argininas. Encontramos que los cambios que se observan en las isoformas de RNA mensajero de RS31 por acción de la luz se deben al proceso de splicing alternativo y no a una degradación diferencial de sus isoformas. Por otro lado, encontramos que el tratamiento de plantas que se encuentran en oscuridad con tricostatina A, una droga que promueve la hiperacetilación de histonas, imita el efecto de la luz sobre el splicing alternativo. Además, demostramos que una mutante de Arabidopsis deficiente en la deacetilación de histonas HD1 muestra un menor efecto de luz a oscuridad que las plantas salvajes. El efecto de la luz sobre el splicing alternativo implica cambios en la elongación de la transcripción: el tratamiento de plantas con camptotecina, droga que inhibe la elongación, imita el efecto de la oscuridad sobre el splicing alternativo. Realizamos mediciones de la tasa de elongación y encontramos que en luz la elongación es más rápida que en oscuridad en el gen de RS31. Finalmente, en plantas de Arabidopsis defectuosas en el factor de elongación TFIIS el efecto de la luz sobre el splicing alternativo de los eventos estudiados se inhibe por completo. Estos resultados muestran que el efecto de la luz sobre el splicing alternativo depende de cambios en la elongación de la transcripción.

Abstract:
Light is an environmental stimulus that regulates several biological processes in plants. Through the chloroplast, light regulates alternative splicing of a subset of genes. In this work, we aim to study the mechanism of light- regulation of alternative splicing. We chose the Ser-Arg-rich splicing factor RS31 as a model and found that changes in the abundance of mRNA isoforms are due to changes in alternative splicing –and are not caused by degradation of mRNA isoforms. Treatment of plants with trichostatin A, a drug that suppresses histone deacetylase activity and therefore increases histone acetylation, mimics the effect of light on RS31 alternative splicing. Furthermore, in an Arabidopsis mutant defective in the histone deacetylase HD1 the effect of light to dark transition on alternative splicing is strongly reduced. The effect of light on alternative splicing involves changes in transcription elongation: treatment of plants with camptothecin, a drug that inhibits transcription elongation, mimics the effect of darkness on alternative splicing. We performed measurements of transcription elongation rate and found that in light-treated plants transcription elongation is faster than in dark-treated plants along the RS31 gene. Finally, in a plant defective in the elongation factor TFIIS the light/dark effect on alternative splicing is completely abolished. These results show that the effect of light on alternative splicing involves changes in transcription elongation.

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Registro:
Título : Regulación del splicing alternativo y de la elongación de la transcripción en plantas por acción de la luz     =    Light-mediated regulation of alternative splicing and transcription elongation in plants
Autor : Godoy Herz, Micaela
Director : Kornblihtt, Alberto
Consejero : Srebrow, Anabella
Jurados : Alvarez, María E.  ; Muschietti, Jorge P.  ; Cánepa, Eduardo T.
Año : 2017-03-23
Editor : Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Filiación : Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias (IFIByNE)
Grado obtenido : Doctor de la Universidad de Buenos Aires en el área de Ciencias Biológicas
Ubicación : Preservación - http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_6132_GodoyHerz
Idioma : Español
Area Temática : Biología / Fisiología Vegetal
Palabras claves : SPLICING ALTERNATIVO; LUZ; TRANSCRIPCION; ARABIDOPSIS; ALTERNATIVE SPLICING; LIGHT; TRANSCRIPTION; ARABIDOPSIS
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