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Ver el documento (formato PDF)   De Panis, Diego Nicolás.  "Estudios genómicos y transcriptómicos de la adaptación al ambiente de cría en un modelo de especiación por especialización ecológica en Drosophila"  (2017-03-27)
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
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Resumen:
Los estudios de secuenciación de alto rendimiento están abriendo nuevos caminos para investigar las respuestas adaptativas que los organismos despliegan en entornos alternativos. Sin embargo, mucho queda por entender sobre las bases genéticas de la adaptación a las plantas hospedadoras. La especies cactófilas de Drosophila que se encuentran en América del Sur tienen distinto grado de divergencia y especialización en la explotación de los cactus que habitan. La utilización de tejidos necróticos como hospedadores ha ligado su historia evolutiva a la expansión, retracción y diversificación de las cactáceas durante los cambios climáticos promovidos por los periodos glaciales del cuaternario. Las especies hermanas D. buzzatii y D. koepferae divergieron hace unos cinco millones de años y actualmente muestran una marcada diferenciación en caracteres de historia de vida, morfología y hábito, que aparentemente habrían evolucionado como adaptaciones a las distintas plantas hospedadoras. En su región simpátrica, ubicada en el noroeste Argentino, utilizan alternativamente cardones (Trichocereus terscheckii) y tunas (Opuntia sulphurea) como recursos de cría, donde el hospedador primario de una resulta en el secundario de la otra. Sin embargo, el cambio de hospedador afecta seriamente los componentes del fitness cuando ambas especies son criadas en el recurso secundario, lo que sugiere un importante papel de los metabolitos secundarios en el proceso de especialización ecológica. En la presente tesis, se estudiaron las particularidades genómicas de estas especies hermanas, así como la expresión génica en diferentes aproximaciones a las condiciones naturales de cría. A partir de los resultados, se desprenden diferencias entre ambas especies, tanto en su arquitectura genética como en su modulación transcripcional. Precisamente la mayor diferencia se encontró en la modulación transcripcional que llevan a cabo en los diferentes recursos de cría, aunque en ambos casos los genes diferencialmente expresados estuvieron principalmente relacionados con detoxificación, óxido-reducción y respuesta a estrés, pero también con desarrollo y procesos neurobiológicos. Esta trabajo aporta nuevos datos sobre el rol de la plasticidad transcripcional y las bases genómicas de estrategias adaptativas a ambientes de cría alternativos.

Abstract:
High-throughput sequencing studies are breaking new ground to investigate the adaptative responses that organisms deploy in alternative environments. Nevertheless much remains to be understood about the genetic basis of host plant adaptation. The cactophilic species of Drosophila that are found in South America have different degrees of divergence and specialization in the exploitation of the cactus they inhabit. The use of necrotic tissue as hosts has linked its evolutionary history to the expansion, contraction and diversification of cacti during climate changes promoted by Quaternary glacial periods. The sister species D. buzzatii and D. koepferae diverged about five million years ago and currently show a marked difference in life history traits, morphology and habit, which apparently have evolved as adaptations to different host plants. In its sympatric region located in northwestern Argentina, they alternatively use cardones (Trichocereus terscheckii) and prickly pears (Opuntia sulphurea) as breeding resources, where the primary host for one results in the secondary of the other. However, the host change seriously affects fitness components when both species are raised in the secondary resource, suggesting an important role of secondary metabolites in the process of ecological specialization. In this thesis, the genomics particularities of these sister species were studied, along with the genetic expression in different approaches to natural breeding conditions. From the results, differences arose between species, both in the genetic architecture as in the transcriptional modulation. Precisely, the biggest difference was found in transcriptional modulation carried out in the different breeding resources, although in both cases the differentially expressed genes were mainly related to detoxification, oxidation-reduction and response to stress, but also with development and neurobiological processes. This work contributes new data onto the role of transcriptional plasticity and the genomic bases of adaptive strategies to alternative rearing environments.

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Registro:
Título : Estudios genómicos y transcriptómicos de la adaptación al ambiente de cría en un modelo de especiación por especialización ecológica en Drosophila     =    Genomic and transcriptomic studies of the adaptation to breeding environment in a speciation model by ecological specialization in Drosophila
Autor : De Panis, Diego Nicolás
Director : Hasson, Esteban
Consejero : Fanara, Juan José
Jurados : Confalonieri, Viviana  ; Rivera Pomar, Rolando  ; Juri Ayub, Maximiliano
Año : 2017-03-27
Editor : Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Filiación : Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Departamento de Ecología, Genética y Evolución (EGE). Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires (IEGEBA)
Grado obtenido : Doctor de la Universidad de Buenos Aires en el área de Ciencias Biológicas
Ubicación : Preservación - http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_6140_DePanis
Idioma : Español
Area Temática : Biología / Genética
Biología / Evolución
Palabras claves : GENOMICA; TRANSCRIPTOMICA; ALCALOIDES; PLASTICIDAD; ADAPTACION; GENOMICS; TRANSCRIPTOMICS; ALKALOIDS; PLASTICITY; ADAPTATION
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