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Wagner, Federico. "Producción de hadrones y jets en colisiones de hadrones polarizados" (2010) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En el presente trabajo se aborda el estudio de la sección eficaz de producción de hadrones y jets en colisionadores hadrónicos. Los cálculos disponibles para estos observables corresponden a cómputos a orden fijo en teoría de perturbaciones y resultan ser, en muchos casos, poco satisfactorios. Con el objeto de obtener predicciones más precisas, se aplican las técnicas de resumación umbral a fin de incluir el aporte de la radiación de gluones soft o colineales al cálculo de orden fijo. En esta tesis consideraremos a los hadrones colisionantes con todos los posibles estados de polarización: no polarizados, polarizados longitudinalmente y, por último, polarizados transversalmente. El incluir el estado de polarización nos permitirá estudiar la estructura de spin de dichos hadrones. Existe actualmente una gran actividad experimental en busca de develar la estructura de spin que presentan los nucleones. En particular, la determinación de la distribución dependiente de spin de los gluones, ∆g, dentro del nucleón es uno de los desafíos mas importantes en el ́área. El colisionador relativista de iones pesados (RHIC), el primer colisionador de protones polarizados, presenta grandes posibilidades de determinar ∆g(x, Q^2 ) sobre un amplio rango de fracciones de momento x y escala Q. Las asimetrías de spin en colisiones pp a altas energía son particularmente sensibles a ∆g, y por lo tanto al contenido gluónico del spin del protón. Los procesos más relevantes para ese propósito son la producción de un hadrón con alto momento transverso pp → hX y la producción de jet pp → jetX. En esta tesis obtenemos las predicciones más precisas posibles para ambos procesos. Presentamos, además, resultados fenomenológicos teniendo en cuenta tanto las facilidades experimentales actuales (RHIC) como las que se espera contar en un futuro cercano (GSI-FAIR y J-PARC).

Abstract:
In this thesis we study the jet and hadron production cross sections in hadronic colliders. These observables are usually computed to fixed order in perturbation theory, approximation that turns out to be not very accurate in some kinematical regimes. In order to obtain more precise predictions, we apply the soft-gluon-treshold- resummation techniques. We consider the colliding hadrons with different states of polarization: unpolarized, longitudinally polarized and transverselly polarized. Through polarization we are able to study the spin structure of these hadrons. There is currently much experimental activity aiming at further unraveling the nucleon’s spin structure. One emphasis is on the determination of the spin-dependent gluon distribution, ∆g, of the nucleon, which ultimately would give the gluon spin contribution to the nucleon spin. Particularly good prospects for determining ∆g(x, Q^2 ) over a wide range of momentum fractions x and scales Q are offered at the Relativistic Heavy-Ion Collider (RHIC), which is the first polarized proton-proton collider. Spin asymmetries in high-energy pp scattering can be particularly sensitive to ∆g. The single-inclusive production of large transverse- momentum (pT ) hadrons, pp → hX and the single-inclusive jet production pp → jetX are good examples of that. We study in this thesis these processes and compute their spin asimetries with the most accurate prediction at present. We present our phenomenological results relevant for planned experiments at the GSI-FAIR, RHIC-PHENIX and J-PARC facilities.

Walsh, Miguel Nicolás. "Teoremas inversos discretos" (2012) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
La presente tesis estudia dos instancias diferentes de teoremas inversos discretos, la primera relacionada con cuestiones de convergencia en la teoría ergódica y la segunda con problemas de distribución local en la teoría de números. El primer resultado nos permite caracterizar aquellas funciones que pueden formar promedios ergódicos no convencionales grandes en la norma L2. Discutimos luego descomposiciones abstractas de estructura y aleatoriedad y las extendemos al contexto de la teoría ergódica, habilitando la posibilidad de estudiar varios niveles de estructura en forma simultánea. Combinando estas herramientas con el teorema inverso previamente mencionado y un proceso inductivo adecuado, logramos demostrar que los promedios ergódicos polinomiales múltiples provenientes de la acción de un grupo nilpotente de transformaciones que preservan la medida en un espacio de probabilidad siempre convergen en norma. Esto responde una conjetura de Bergelson y Leibman. El segundo resultado concierne la distribución de conjuntos en clases residuales. Introducimos los conceptos de conjuntos característicos y genéricos, y los aplicamos en el marco de la criba de Gallagher para mostrar que si un conjunto grande de puntos enteros S ⊆ {1,...,N}d, d > 1, ocupa pocas clases residuales modulo p, para muchos primos p, entonces debe estar esencialmente contenido en el conjunto de soluciones de una ecuación polinomial de grado acotado. Esto resuelve una pregunta de Helfgott y Venkatesh.

Abstract:
The present thesis studies two diferent instances of discrete inverse theorems, the first one pertaining convergence issues in ergodic theory and the second one problems of local distribution in number theory. The first result allows us to characterize those functions that can form nonconventional ergodic averages with large L2 norm. We then discuss abstract structurerandomness decompositions and extend them to the context of ergodic theory, by allowing for diferent levels of structure to be handled simultaneously. Combining these tools with the aforementioned inverse theorem and an adequate induction procedure, we are able to show that multiple polynomial ergodic averages arising from nilpotent groups of measure preserving transformations of a probability space always converge in norm. This answers a conjecture of Bergelson and Leibman. The second result concerns the distribution of sets in residue classes. We introduce the concepts of characteristic and generic sets, and apply them in the framework of the larger sieve to show that if a big set of integer points S ⊆ {1,...,N}d, d > 1, occupies few residue classes mod p, for many primes p, then it must essentially lie in the solution set of some polynomial equation of low degree. This settles a question of Helfgott and Venkatesh.

Wargon, Victoria. "Resistencia constitutiva y adquirida al tratamiento hormonal de carcinomas mamarios murinos" (2010) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Los mecanismos por los cuales los estrógenos y los progestágenos, a través de sus respectivos receptores (RE y RP), participan en el desarrollo y crecimiento del cáncer de mama es un tema de gran interés ya que su detección se utiliza como factor pronóstico y orienta la terapéutica hacia una de tipo hormonal. En nuestro laboratorio se ha desarrollado un modelo experimental de adenocarcinomas mamarios murinos inducidos por acetato de medroxiprogesterona (MPA) en ratones hembras vírgenes de la cepa BALB/c. Se establecieron líneas tumorales hormono-dependientes (HD) y hormono-independientes (HI) que expresan RE, alfa (REα) y beta (REβ), y las dos isoformas del RP (RPA y RPB). Los tumores HI se clasifican en respondedores (sensibles) y resistentes a la terapia con antiprogestágenos. Hemos generado a su vez por presión selectiva variantes tumorales con resistencia adquirida a los mismos. Utilizando tres familias tumorales de este modelo, demostramos que los tumores sensibles expresan mayor nivel de RPA que de RPB, mientras que lo opuesto se observa en los resistentes. Esta diferencia sería un posible marcador para discriminar un tumor sensible de uno resistente. Pudimos determinar que la resistencia adquirida puede revertir ya sea por tratamiento hormonal, o por cultivo y en todos los casos esta reversión se ve acompañada de la reexpresión de RPA. Demostramos que el silenciamiento de RPA en los tumores con resistencia adquirida se debe a metilación del promotor de PRA y que el tratamiento con el agente desmetilante 5azadC desensibiliza los tumores al antiprogestágeno. No hemos podido hasta el momento dilucidar cuál es el mecanismo que silencia la expresión de RPA en los tumores con resistencia adquirida, sin embargo la plasticidad que observamos en la expresión de esta isoforma nos hace pensar que se trataría de algún otro mecanismo epigenético. La fuerte correlación que hemos observado a lo largo de este trabajo de investigación entre la expresión de RPA y la sensibilidad a los antiprogestágenos sugieren que la terapia con antiprogestágenos debería ser considerada como posible tratamiento para tumores de mama con alta expresión de RPA.

Abstract:
The mechanisms by which estrogens and progestins activate estrogen (ER) and progesterone receptors (PR) respectively are still a main and controversial area in breast cancer research. The detection of these receptors is used as a prognostic factor and patients with high levels of ER and PR will be treated with a hormone therapy aimed to block estrogen synthesis or to inhibit ER activation. There is however compelling evidence that points out that PR is also involved in the development and progression of breast carcinomas. In our Laboratory we have developed an experimental model of mammary carcinomas induced by the continuous administration of medroxyprogesterone acetate (MPA) into BALB/c female mice. MPA-dependent tumors (HD) are maintained by syngeneic transplantations in MPA-treated mice. Spontaneously, tumors which are able to grow without exogenous hormone supply may arise, and these are referred to as hormone independent tumors (HI). Both tumor types express ER alpha (ERα) and beta (ERβ), and both isoforms of PR (PRA and PRB). HI tumors are classified as antiprogestin responsive or antiprogestins resistant tumors. We have already demonstrated that PR play a key role mediating tumor growth in both tumor types since antisense oligonucleotides of PR and different antiprogestins inhibit their growth. In this study we analyzed 3 responsive, 3 acquired resistant and 2 constitutive resistant tumors from three different tumor families from the MPA breast cancer model. We demonstrated that the difference between these responsive and resistant tumors relies in the PRA/PRB ratio, being PRA higher than PRB in responsive tumors. Interestingly the acquired resistant phenotype was possible to be reverted and this reversion was significantly associated with an increase in PRA expression. We demonstrated that only in the constitutive-resistant tumors, PRA expression was silenced by DNA methylation. This prompted us to investigate whether the treatment of constitutive resistant tumors with a demethylating agent could restore PRA expression and antiprogestins responsiveness. We found that 5-aza- 2 ́-deoxycytidine treatment induced PRA expression and RU-486 responsiveness in vitro and in vivo experiments. Furthermore, high levels of DNA methyltransferase (Dnmts) were detected in these tumors. In conclusion, our results suggest that methyltransferase inhibitors in combination with antiprogestins may be effective in the treatment of constitutive-resistant carcinomas with a high DNA methyltransferase level. The correlation between PRA expression and antiprogestins responsiveness supports the hypothesis that antiprogestin should be used for the treatment of breast cancer patients showing high expression of PRA.

Wengier, Diego Leonardo. "Aislamiento y caracterización del ligando del pistilo que interactúa con el sistema de receptores quinasa LePRK1 y LePRK2 de polen de Solanum lycopersicon (tomate)" (2008) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Los LePRKs son receptores quinasa que se localizan en la membrana plasmática de polen, posiblemente mediando interacciones polen-pistilo. Previamente, hemos demostrado que LePRK2 se encuentra fosforilada en polen maduro y germinado, y se desfosforila cuando microsomas de polen son incubados con extractos de estigma-estilo. Esto sugiere que por lo menos LePRK2 podría estar transduciendo una señal del pistilo a través de la actividad de LePRK2. En esta tesis, mostramos que la desfosforilación de LePRK2 está mediada por una molécula proveniente del pistilo resistente al tratamiento térmico, alcalino y proteasas. Basándonos en la desfosforilación de LePRK2, desarrollamos un protocolo de purificación con el cual obtuvimos un pico aislado de ~3550 Da (determinado por UV-MALDI-TOF MS) correspondiente a esta molécula peptídica que nombramos MrX. Con el fin de evaluar los efectos de MrX en tubos polínicos en crecimiento, realizamos ensayos de germinación in vitro en presencia de MrX parcialmente purificado y determinamos la longitud del tubo polínico como marcador del estado fisiológico. La adición de MrX al medio de germinación resultó en un aumento del largo del largo del tubo polínico en una forma dependiente de la dosis, mientras que las fracciones control no tuvieron efecto alguno. Nuestra hipótesis plantea que las interacciones polen-pistilo a través del complejo de LePRKs involucran la percepción de MrX por LePRK2, seguido de una desfosforilación de ésta y un incremento de la tasa de crecimiento del tubo polínico.

Abstract:
LePRK1 and LePRK2 are pollen specific receptor kinases that belong to a plasma membrane high molecular weight complex possibly involved in pollen-pistil interactions. Previously, we have shown that LePRK2 is phosphorylated in mature and germinated pollen grains, but is dephosphorylated when pollen microsomes are incubated with stigma-style extracts. This suggests that LePRK complex might be transducing a signal from pistils through LePRK2 activity. In this thesis, we show that LePRK2 dephosphorylation is mediated by a heat-, base- and protease-resistant molecule from pistils. Based on LePRK2 phosphorylation, we developed a purification protocol and obtained an isolated peak of ~3550 Da peptidic compound (as determined by UV-MALDI-TOF MS) that we named MrX. In order to assess the effects of MrX on growing pollen tubes, we did in vitro germination assays in the presence of partially purified fraction of MrX and determined pollen tube length as a marker of the physiological state. MrX addition to germination medium resulted in pollen tube length increase in a dose-dependent manner, but not when pollen grains were incubated with control fractions. We hypothesize that pollen-pistil interactions through LePRK complex involve MrX perception by LePRK2, followed by LePRK2 dephosphorylation and an increase in pollen tube growth rate.

Werenkraut, Victoria. "Patrones altitudinales en la diversidad de coleópteros y hormigas epígeos del noroeste de la Patagonia argentina" (2010) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Se estudió la influencia de factores metodológicos y biológicos sobre los patrones altitudinales en la diversidad de artrópodos, con énfasis en coleópteros y hormigas. A escala global, un meta-análisis de 109 gradientes publicados mostró que el patrón altitudinal en la riqueza de especies de artrópodos tiene múltiples formas, aunque la percepción del patrón puede estar influida por el método empleado para identificar la forma y la calidad de los datos. A escala local, un estudio de campo realizado en cinco montañas, en el noroeste de la Patagonia argentina, mostró cambios altitudinales en la composición de ensambles de especies de coleópteros y hormigas asociados a distintas variables ambientales y una subdivisión fina de los ambientes. Los patrones altitudinales en la riqueza de especies y abundancia de individuos difirieron sustancialmente entre coleópteros y hormigas. Se confirmó la alta diversidad de coleópteros, y la baja diversidad de hormigas. Ambos taxa mostraron la dominancia de pocas especies muy abundantes y muchas especies raras. Distintos factores ambientales explicaron variaciones locales en la diversidad en distintos ambientes del gradiente altitudinal, y afectaron de manera diferencial a coleópteros y hormigas.

Abstract:
This study analysed the influence of methodological and biological factors on the altitudinal diversity patterns in arthropods, with emphasis in beetles and ants. At global scale, a meta-analysis of 109 published gradients showed that the altitudinal pattern in arthropod richness has multiple forms, although the perception of the pattern can be influenced by the method used to identify the form and the quality of basic data. At local scale, a field-study developed in five mountains, in north-western Patagonia, Argentina, showed altitudinal changes in the composition of beetle’s and ant’s species assemblages, associated with different environmental variables, and a fine subdivision of environments. The altitudinal patterns in the species richness and abundance of individuals differed substantially between beetles and ants. The high diversity of beetles and the low diversity of ants were confirmed. Both taxa showed the dominance of a few, very abundant species, and a lot of rare species. Different environmental factors accounted for local variations in diversity in different environments along the altitudinal gradient, and differentially affected beetles and ants.

Westergaard, Gastón Germán. "Búsqueda de potenciales blancos para el diseño de drogas anti-parasitarias en dominios de interacción proteína-proteína y proteína-ARN en Trypanosoma cruzi" (2011) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En el presente trabajo encaramos la construcción de vectores destino Gateway®, pTREX-GW y pTREX-HGX-GW. Mediante el sistema de detecciones rápidas con fusiones a GFP exploramos una serie de mutantes Tcp14 para definir con exactitud las señales involucradas en su localización nuclear. De esta forma, pudimos determinar que Tcp14 no depende de su unión al factorSF3b155 para ingresar al núcleo, sino que posee una señal propia no descripta hasta ahora, que podría ser explotada como posible blanco de drogas. Otro modelo ambicioso de blanco de drogas son los dominios WW, módulos proteicos que median interacciones proteína-proteína reconociendo motivos peptídicos ricos en prolina. Un ejemplo promisorio entre las proteínas con WW son las TcZFPs. Se utilizó un vector inducible por tetraciclina para sobreexpresar TcZFP1b en las formas epimastigotes. Tras la inducción, los parásitos dejaron de dividirse después de 60 hs de la adición de tetraciclina y una extensa muerte celular se produjo después de 5 días. Las células se observaron como “monstruos” con múltiples flagelos y el contenido de ADN bloqueado en la citocinesis, provocando la muerte celular. Para analizar los cambios globales en la expresión génica, se llevo a cabo una pirosecuenciación de los ARNm en un Genome Sequencer FLX 454-Roche. Un grupo de 70 genes mostraron una regulación positiva mayor a 3 veces respecto al control, mientras que 35 genes mostraron una regulación negativa menor a 3 veces respecto el control. En general, se observó que varios ARNm de funciones relacionadas cambiaron de manera concertada como un patrón en respuesta post-transcripcional a la sobreexpresión de TcZFP1b, que parecería activar parte de un programa para diferenciar a los epimastigotes en tripomastigotes.

Abstract:
In this work we approach the construction of Gateway® destination vectors: pTREX-GW y pTREX-HGX-GW. Through the rapid detection system with GFP fusions we explored a series of Tcp14 mutants to define the precise signals involved in nuclear localization. Thus, we could determine that Tcp14 not depend on its binding factor SF3b155 to enter the nucleus, but has a non-descript, nuclear localization signal (NLS), which could be exploited as a potential target for drugs. Another ambitious model drug target are the WW domains, protein modules that mediate protein-protein interactions by recognizing proline-rich peptide motifs. A promising example between proteins with WW are TcZFPs. We used a tetracycline-inducible vector to overexpress TcZFP1b in epimastigotes. After induction, the parasites stopped dividing after 60 h of the addition of tetracycline and extensive cell death occurred after 5 days. The cells were seen as "monsters" with multiple flagella and DNA content in cytokinesis blocked, causing cell death. To analyze global changes in gene expression pyrosequencing of the mRNA was carried out in a Genome Sequencer FLX 454-Roche. A group of 70 genes showed an upregulation of more than 3 times compared to the control, while 35 genes showed a downregulation of less than 3 times compared to control. In general, we observed that several mRNA-related functions moved in concert as a pattern in post-transcriptional response to overexpression of TcZFP1b, which seems to activate part of a program to differentiate epimastigotes into trypomastigotes.

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